يستخدم تفاعل سلسلة البوليميراز بشكل أساسي لتضخيم الجينات العلمية والسريرية ، وتضخيم الجين PCR النوعي ، والتضخم الجيني للكميات الخالية من الإنزيمات / التضخيم الجيني للحمض النووي ، ورقاقة الجين وتطبيقات أخرى لتحليل الجينات.